Está constituido por dos edificios contiguos que se comunican entre sí. El Palacio de los Gobernadores Generales o Capitanía General, en la parte noroeste y El Palacio de la Real Audiencia y Cancillería General, construidos simultáneamente entre los años de 1500 y 1525.

El Palacio de los Gobernadores Generales o Capitanía General fabricado en mampostería y piedra de primera calidad, sobrio y severo, de apariencia casi militar, mezcla los estilos gótico isabelino y plateresco renacentista. Aquí residía el Gobernador de la Española. 

En el Palacio de la Real Audiencia y Cancillería General, ubicado en la parte suroeste del monumento, predominan el ladrillo y la mampostería. En su parte baja presenta una serie de arcos de ladrillo de arcilla blanca. Las ventanas de la planta superior, por su parte, muestran un perfil conopial de origen gótico o mudéjar.

Fue erigido para alojar el primer tribunal de justicia en el Nuevo Mundo, creado por el Rey Fernando el Católico el 5 de Octubre de 1511 con la intención de limitar el poder del Gobernador General de la Isla. En su planta baja funcionaba la Cancillería y en la alta, la Real Audiencia que estaba compuesta de un Presidente y de tres o cuatro oidores (jueces).

En los salones de la Real Audiencia se celebraban importantes reuniones o juntas compuestas por los oficiales reales y los jueces de apelación para discutir y determinar asuntos relacionados tanto con la política como con el comercio y la religión.

En estas reuniones participaban también el Obispo de la Concepción, Don Pedro Suárez de Deza, y representantes de los Franciscanos, Dominicos y Mercedarios, además, de los propios encomenderos.

Según reseña la historia, nunca fueron invitados los caciques indígenas por más inteligentes o hábiles que se les considerara.

La Real Audiencia ejerció jurisdicción sobre todas las islas vecinas y sobre Tierra Firme del Mar Océano, como se decía entonces, alcanzando su mayor importancia entre los años de 1526 y 1540.

Tuvo que zanjar las diferencias entre Alvarado y Almagro, apoyar a Pizarro contra los indios del Cuzco en rebelión, e intervenir en las provincias de América Central, Venezuela y la Florida. También La Luisiana, en aquellos tiempos territorio español, dependió de este tribunal de Santo Domingo.

La estructura original de Las Casas Reales han sufrido cambios a lo largo de la historia. En 1807 el general francés Louis Ferrand afrancesó el edificio. En el último año del gobierno del persidente Carlos F. Morales Languasco -24 de octubre de 1903 al 24 de diciembre de 1905-  se realizaron otras modificaciones para poder utilizar el edificio como casa del gobierno.  Durante el mandato del presidente Rafael Leonidas Trujillo se hicieron modificaciones en yeso para poder albergar oficinas gubernamentales.